rongo

I roto i nga tau tekau kua hipa, kua whakamahia whanuitia te hangarau raupapa ira i roto i te rangahau mate pukupuku me te mahi haumanu, ka noho hei taputapu nui hei whakaatu i nga ahuatanga ngota o te mate pukupuku. Ko te ahunga whakamua i roto i te tātaritanga rapoi me te rongoa kua whaaia te whakawhanaketanga o nga ariā whakamaori mate pukupuku me te nui o nga huringa ki te waahi katoa o te mate pukupuku me te maimoatanga. Ka taea te whakamahi i nga whakamatautau ira hei whakatupato mo te mate pukupuku, hei arahi i nga whakatau maimoatanga me te arotake i te matapaetanga, a he taputapu nui hei whakapai ake i nga putanga haumanu a te manawanui. I konei, ka whakarāpopotohia nga tuhinga tata nei i whakaputaina i roto i te CA Cancer J Clin, JCO, Ann Oncol me etahi atu pukapuka hei arotake i te whakamahinga o te whakamatautau ira i roto i te mate pukupuku me te maimoatanga.

Ko nga huringa o te Somatic me nga huringa irariki. I te nuinga o te waa, ko te mate pukupuku ka puta mai i nga huringa DNA ka taea te tuku mai i nga maatua (whakarereketanga o te germline) ka riro mai ranei i te wa o te pakeke (te huringa somatic). Ko nga huringa o nga raina irariki mai i te whanautanga mai, ko te tikanga ka mau te huringa i roto i te DNA o ia pūtau i roto i te tinana ka taea te tuku ki nga uri. Ko nga huringa Somatic ka riro i nga tangata takitahi i roto i nga pūtau kore-gametic, a, i te nuinga o te waa kaore e tukuna ki nga uri. Ka taea e nga irakētanga o te germline me te somatic te whakakore i te mahi noa o nga pūtau ka arahi ki te panoni kino o nga pūtau. Ko nga huringa Somatic te tino taraiwa o te mate kino me te tohu koiora tino matapae i roto i te oncology; engari, tata ki te 10 ki te 20 paiheneti o nga turoro puku e mau ana i nga iraera irariki e tino piki ake ai te mate pukupuku, a he rongoa hoki etahi o enei irakētanga.
Te hurihanga taraiwa me te rerekee o nga kaihihi. Kaore nga momo DNA katoa e pa ana ki te mahi o te pūtau; i runga i te toharite, e rima ki te tekau nga huihuinga ira tangata, e mohiotia ana ko "te inenga taraiwa," hei whakaoho i te whakahekenga o nga pūtau. He maha nga wa ka puta nga huringa taraiwa i roto i nga ira e hono tata ana ki nga mahi ora o te pūtau, penei i nga ira e uru ana ki te ture tipu o nga pūtau, te whakatikatika DNA, te whakahaere huringa pūtau me etahi atu tukanga ora, me te kaha ki te whakamahi hei kaupapa rongoa. Heoi, he tino nui te tapeke o nga huringa i roto i tetahi mate pukupuku, mai i te mano mano i etahi mate pukupuku uma ki te neke atu i te 100,000 i roto i etahi momo mate pukupuku rewharewha tino rerekee me te endometrial. Ko te nuinga o nga huringa karekau he iti noa iho te hiranga koiora, ahakoa ka puta te irakētanga i roto i te rohe whakawaehere, ka kiia he "whakarereke haere" enei mea iti. Mena ka tohu tetahi momo ira i roto i tetahi momo pukupuku i tana urupare ki te maimoatanga ranei, ka kiia te momo rereke ka taea te whakahaere hauora.
Oncogenes me nga ira aukati puku. Ko nga ira e rerekee ana i te mate pukupuku ka wehea kia rua nga waahanga, ko te oncogenes me nga ira aukati puku. I roto i nga pūtau noa, ko te pūmua e whakawaeheretia ana e te oncogenes te nuinga o te mahi ki te whakatairanga i te tipu o te pūtau me te aukati i te apoptosis pūtau, ko te pūmua i whakawaeheretia e nga ira oncosuppressor te nuinga o te kawenga mo te whakahaere kino i te wehenga pūtau kia mau tonu ai te mahi pūtau. I roto i te tukanga panoni kino, ko te huringa ira tangata ka arahi ki te whakarei ake i te mahi oncogene me te heke, te ngaro ranei o te mahi ira oncosuppressor.
Te rereketanga iti me te rereketanga o te hanganga. Ko enei nga momo rerekee e rua i roto i te genome. Ko nga momo rereke iti ka whakarereke i te DNA ma te whakarereke, te whakakore, te taapiri ranei i te iti o nga turanga, tae atu ki te whakauru turanga, te whakakore, te whakawhiti anga, te tiimata i te mate o te codon, te aukati i nga huringa mate o te codon, me etahi atu. Ko enei whakarereketanga ka whakaitihia, ka whakarei ake ranei te mahi pūmua. I tua atu i nga huringa i te taumata o nga ira takitahi, ko nga waitohu ira tangata he wahanga ano o nga purongo raupapa haumanu. Ka kitea nga hainatanga ira hei tauira uaua o nga rereketanga iti me te hanganga, tae atu ki te kawenga mutation tumo (TMB), te koretake o te microsatellite (MSI), me nga hapa o te whakakotahitanga homologous.

Te irirangi Clonal and subclonal mutation. Kei roto i nga pūtau puku katoa nga huringa o te clonal, kei roto i te tātaritanga, ka noho tonu i muri i te ahunga whakamua o te maimoatanga. Na reira, ka taea te whakamahi i nga huringa clonal hei kaupapa rongoa pukupuku. Ko nga huringa iraroto kei roto noa i te waahanga o nga pūtau mate pukupuku, ka kitea pea i te timatanga o te tātaritanga, engari ka ngaro ka hoki mai ano ka puta mai ranei i muri i te maimoatanga. Ko te rerekeetanga o te mate pukupuku e pa ana ki te maha o nga huringa iraroto i roto i te mate pukupuku kotahi. Ko te mea nui, ko te nuinga o nga huringa taraiwa haumanu nui i roto i nga momo mate pukupuku noa he rerekee clonal me te mau tonu puta noa i te mate pukupuku. Ko te parenga, he maha nga wa ka takawaengahia e nga subclones, kaore pea e kitea i te wa o te tātaritanga engari ka puta ina hoki ana i muri i te maimoatanga.

Ko te tikanga tuku iho o te FISH, te karyotype pūtau ranei ka whakamahia hei kite i nga huringa i te taumata chromosomal. Ka taea te whakamahi FISH ki te kite i te whakakotahitanga ira, te whakakore, me te whakakaha, ka kiia ko te "paerewa koura" mo te kimi i aua momo rerekee, me te tino tika me te tairongo engari he iti te puta. I roto i etahi mate pukupuku hematologic, ina koa te reukemia whakapeka, kei te whakamahia tonu te karyotyping hei arahi i te taatutanga me te matapaetanga, engari kei te whakakapi haeretia tenei tikanga e nga whakamatautau irapoi kua tohua penei i te FISH, WGS, me NGS.
Ka taea te kite i nga huringa o nga ira takitahi e te PCR, te PCR wa-tūturu me te PCR maturuturu mamati. He tino tairongo enei tikanga, he mea tino pai mo te kimi me te aro turuki i nga reinga iti e toe ana, a ka taea te whiwhi hua i roto i te wa poto, ko te kino ko te mea he iti te awhe rapu (te nuinga ka kitea he rereke i roto i te kotahi, i etahi ira ranei), he iti te kaha ki nga whakamatautau maha.
Ko te Immunohistochemistry (IHC) he taputapu aro turuki i runga i te pūmua e whakamahia nuitia ana ki te kite i te whakaaturanga o nga tohu koiora penei i te ERBB2 (HER2) me nga kaiwhakawhiwhi estrogen. Ka taea hoki te whakamahi IHC ki te kite i nga pūmua kua rerekee (pēnei i te BRAF V600E) me te whakakotahitanga ira motuhake (pēnei i te whakakotahitanga ALK). Ko te painga o te IHC he ngawari ki te whakauru ki roto i te mahinga tātaritanga o te kiko, na reira ka taea te whakakotahi me etahi atu whakamatautau. I tua atu, ka taea e IHC te tuku korero mo te waahi o te pūmua subcellular. Ko nga ngoikoretanga ko te iti o te tauine me te nui o nga hiahia whakahaere.
Whakaraupapa Whakatupuranga Tuarua (NGS) Ko te NGS e whakamahi ana i nga tikanga whakarara whakarara teitei ki te kite i nga rereketanga i te taumata DNA me/ranei RNA. Ka taea te whakamahi i tenei tikanga ki te whakaraupapa i te katoa o te ira (WGS) me nga rohe ira o te paanga. Ko te WGS e whakarato ana i nga korero rerekee ira tino matawhānui, engari he maha nga arai ki tana tono haumanu, tae atu ki te hiahia mo nga tauira kiko pukupuku hou (kaore ano te WGS e pai mo te tarai i nga tauira kua kore e nekehia te formalin) me te utu nui.
Ko te raupapatanga NGS e whaaia ana ko te raupapatanga exon katoa me te roopu ira ira. Ko enei whakamatautau ka whakarangatira i nga rohe e pa ana ki nga rangahau DNA, ki te PCR whakarahi ranei, na reira ka whakaiti i te nui o te raupapatanga e hiahiatia ana (ko te exome katoa te 1 ki te 2 paihēneti o te genome, tae atu ki nga panui nui kei roto e 500 nga ira he 0.1 ōrau noa iho o te genome). Ahakoa he pai te mahi o te raupapa exon katoa i roto i nga kopa kua oti te whakau, he nui tonu te utu. Ko nga huinga ira whainga he ohaoha me te tuku ngawari ki te whiriwhiri ira hei whakamatautau. I tua atu, ko te hurihanga DNA kore utu (cfDNA) kei te puta ake hei whiringa hou mo te tātaritanga ira tangata o nga turoro mate pukupuku, e kiia nei ko te koiora wai. Ka taea e nga pūtau mate pukupuku me nga pūtau noa te tuku i te DNA ki roto i te toto, a ko te DNA i whakahekehia mai i nga pūtau mate pukupuku e kiia ana ko te DNA tumo tohanga (ctDNA), ka taea te tātari kia kitea he rerekee pea kei roto i nga pūtau puku.
Ko te whiriwhiringa o te whakamatautau ka whakawhirinaki ki te raru haumanu motuhake hei whakatika. Ko te nuinga o nga tohu koiora e pa ana ki nga maimoatanga kua whakaaetia ka kitea e te FISH, IHC, me nga tikanga PCR. Ko enei tikanga e tika ana mo te kite i te iti o nga tohu koiora, engari kaore i te whakapai ake i te kaha o te kitenga me te piki haere o te whakaputa, a, mehemea he maha nga tohu koiora ka kitea, kaore pea e nui te kiko mo te rapu. I etahi mate pukupuku motuhake, penei i te mate pukupuku o te huhu, he uaua ki te tiki tauira kiko me te maha o nga tohu koiora hei whakamatautau, he pai ake te whakamahi i te NGS. Hei whakamutunga, ko te whiriwhiringa o te whakamatautau ka whakawhirinaki ki te maha o nga tohu koiora hei whakamatautau mo ia turoro me te maha o nga turoro hei whakamatautau mo te tohu koiora. I etahi wa, ko te whakamahinga o te IHC / FISH he rawaka, ina koa kua tautuhia te whaainga, penei i te kitenga o nga kaiwhakawhiwhi o te estrogen, nga kaiwhakawhiwhi progesterone, me te ERBB2 i nga turoro mate pukupuku uma. Mena ka hiahiatia he rangahau matawhānui mo nga huringa ira tangata me te rapu mo nga whaainga rongoa ka taea, he pai ake te whakarite me te utu-utu a NGS. I tua atu, ka whakaarohia pea te NGS i roto i nga keehi he rangirua, he koretake ranei nga hua IHC/FISH.

Ko nga aratohu rereke e whakaatu ana ko nga turoro e tika ana mo te whakamatautau ira. I te tau 2020, i tukuna e te ESMO Precision Medicine Working Group nga taunakitanga whakamatautau NGS tuatahi mo nga turoro he mate pukupuku matatau, e taunaki ana i nga whakamatautau NGS mo te mate pukupuku o te huhu kore-squamous kore-iti, mate pukupuku prostate, mate pukupuku colorectal, mate pukupuku ngongo, me nga tauira pukupuku pukupuku ovarian, a i te tau 2024, ka whakahouhia e te ESMO te whakauru o te mate pukupuku o te u, e taunaki ana i te whakaurunga o te pukupuku o te pukupuku. Pērā i te puku stromal gastrointestinal, sarcoma, mate pukupuku thyroid me nga mate pukupuku o te takenga mai.
I te tau 2022, ko te Whakaaro Haumanu a ASCO mo te whakamatautau ira ira tangata i roto i nga turoro me te mate pukupuku metastatic, matatau ranei e kii ana mena ka whakaaetia he rongoa e pa ana ki te tohu koiora mo nga turoro me nga pukupuku totoka metastatic ranei, ka tūtohuhia te whakamatautau ira mo enei turoro. Hei tauira, me mahi nga whakamatautau ira ira ki nga turoro melanoma metastatic hei tirotiro mo nga huringa BRAF V600E, i te mea kua whakaaetia nga aukati RAF me MEK mo tenei tohu. I tua atu, me mahi ano nga whakamatautau ira mena ka kitea he tohu mo te aukati mo te rongoa ka tukuna ki te manawanui. Ko te Egfrmab, hei tauira, kaore i te whai hua ki te mate pukupuku o te KRAS mutant colorectal. I te wa e whakaarohia ana te pai o te manawanui mo te raupapa ira, me whakauru te mana tinana o te manawanui, nga mate, me te wahanga puku, no te mea ko te raupapa o nga waahanga e hiahiatia ana mo te raupapa ira, tae atu ki te whakaaetanga o te manawanui, te tukatuka taiwhanga, me te tātaritanga o nga hua raupapa, me whai te manawanui ki te kaha tinana me te roanga o te ora.
I tua atu i nga huringa somatic, me whakamatau ano etahi mate pukupuku mo nga ira germline. Ko te whakamatautau mo nga huringa raina irariki ka awe pea i nga whakatau maimoatanga mo nga mate pukupuku penei i te BRCA1 me te BRCA2 irakētanga i roto i te u, ovarian, prostate, me nga mate pukupuku pancreatic. Ko nga huringa Germline ka whai paanga ano mo te tirotiro me te aukati i te mate pukupuku a muri ake nei ki nga turoro. Ko nga turoro e tika ana mo te whakamatautau mo nga whakawhitinga ira tangata me tutuki etahi tikanga, e whai waahi ana ki nga ahuatanga penei i te hitori o te whanau o te mate pukupuku, te tau i te wa e mate ana, me te momo mate pukupuku. Heoi ano, he maha nga turoro (tae atu ki te 50%) e mau ana i nga huringa pathogenic i roto i te raina iroriki kaore e tutuki i nga paearu tuku iho mo te whakamatautau mo nga huringa raina irariki i runga i te hitori o te whanau. No reira, ki te whakanui ake i te tohu o nga kaikawe rerekee, e taunaki ana te National Comprehensive Cancer Network (NCCN) kia whakamatauria te katoa, te nuinga ranei o nga turoro he u, ovarian, endometrial, pancreatic, colorectal, prostate mate pukupuku ranei kia whakamatauria mo nga rereke o te raina irariki.
Mo te wa o te whakamatautau ira, na te mea ko te nuinga o nga huringa taraiwa haumanu nui he karaka me te ahua pumau i roto i te roanga o te mate pukupuku, he mea tika kia mahia nga whakamatautau ira ki nga turoro i te wa e kitea ana he mate pukupuku matatau. Mo nga whakamatautau ira ka whai ake, ina koa i muri i te whakamaaramatanga irapoi, he pai ake te whakamatautau ctDNA i te DNA kiko pukupuku, na te mea kei roto i te DNA toto te DNA mai i nga mate pukupuku katoa, he pai ake te whiwhi korero mo te rerekeetanga o te pukupuku.
Ko te tātaritanga o te ctDNA i muri i te maimoatanga ka taea te matapae i te urupare puku ki te maimoatanga me te tautuhi i te ahunga whakamua o te mate i mua atu i nga tikanga atahanga paerewa. Engari, ko nga tikanga mo te whakamahi i enei raraunga hei arahi i nga whakataunga maimoatanga kaore ano kia whakatauhia, kaore i te tūtohuhia te tātaritanga ctDNA engari i nga whakamatautau haumanu. Ka taea hoki te whakamahi i te ctDNA ki te aromatawai i nga toenga iti i muri i te pokanga puku tuwhena. Ko te whakamatautau ctDNA i muri i te pokanga he tino tohu mo te haere whakamua o nga mate ka whai ake, ka awhina pea ki te whakatau mena ka whai hua te manawanui mai i te mahi haumanu awhina, engari kaore i te tūtohutia kia whakamahia te ctDNA i waho o nga whakamatautau haumanu hei arahi i nga whakataunga chemotherapy adjuvant.

Tukatuka Raraunga Ko te mahi tuatahi i roto i te raupapatanga ira ko te tango i te DNA mai i nga tauira turoro, te whakarite whare pukapuka, me te whakaputa raraunga raupapa mata. Ko nga raraunga mata e hiahia ana ki te tukatuka ano, tae atu ki te tarai i nga raraunga kounga iti, te whakatairite ki te ira tohutoro, te tautuhi i nga momo rerekee na roto i nga momo huringa tātaritanga rereke, te whakatau i te paanga o enei huringa ki te whakamaoritanga pūmua, me te tātari i nga rereketanga o te raina irariki.
I hangaia te tohu ira taraiwa hei wehe i nga rerekeetanga o te taraiwa me nga kaihihi. Ko nga whakarereketanga o te taraiwa ka ngaro, ka piki ake ranei te mahi ira ira pukupuku. Ko nga momo rereke iti e arai atu ai ki te kore whakahohenga o nga ira kaipahua puku ko nga rerekee koretake, nga whakarereketanga frameshift, me nga whakarereketanga o te waahi hono matua, tae atu ki te iti o te wa ka timata te whakakore i te codon, ka mutu te whakakore i te codon, me te whānuitanga o nga huringa whakauru / whakakorenga intron. I tua atu, ko nga whakarereketanga ngaro me nga huringa whakauru whakauru / whakakorenga iti ka taea hoki te ngaro o te mahi ira ira pukupuku ina pa ana ki nga waahi mahi nui. Ko nga momo hanganga e arai atu ai ki te ngaro o te mahi ira ira aukati puku ko te whakakorenga ira ira, i te oti ranei, me etahi atu momo momo ira ka arahi ki te whakangaromanga o te anga panui ira. Ko nga momo rereke iti ka piki ake te mahi oncogenes ko nga whakarereketanga ngaro me nga whakauru whakauru / whakakore i etahi wa e aro ana ki nga rohe mahi pūmua nui. I roto i nga keehi onge, ka taea e te tapahi pūmua, te whakarereketanga o te waahi ranei ki te whakahohe i te oncogenes. Ko nga rereketanga o te hanganga e arahi ana ki te oncogene activation ko te whakakotahitanga ira, te whakakore ira, me te taapiri ira.
Ko te whakamaoritanga haumanu o te rereketanga o te ira tangata e aromatawai ana i te hiranga haumanu o nga whakarereketanga kua tautuhia, ara, to ratou uara tātaritanga, tohu tohu, rongoa rongoa ranei. He maha nga punaha tohu i runga i nga taunakitanga ka taea te whakamahi hei arahi i te whakamaoritanga haumanu o te rereketanga ira.
Ko te Raraunga Raraunga Mataora Oncology o Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (OncoKB) ka whakarōpū i nga momo ira ki nga taumata e wha i runga i to raatau uara matapae mo te whakamahi tarukino: Taumata 1/2, nga tohu koiora kua whakaaetia e te FDA, e tohu ana i te urupare a tetahi tohu motuhake ki tetahi rongoa kua whakaaetia; Ko te Taumata 3, ko nga tohu koiora kua whakaaetia e te FDA, kaore ranei i whakaaetia e tohu ana i te whakautu ki nga raau taero hou kua whakaatuhia i roto i nga whakamatautau haumanu, me te Taumata 4, nga tohu koiora kaore i whakaaetia e te FDA e tohu ana i te whakautu ki nga raau taero hou kua whakaatuhia he taunakitanga koiora i roto i nga whakamatautau haumanu. I taapirihia he roopu tuarima e pa ana ki te aukati maimoatanga.
Ko nga aratohu a te American Society for Molecular Pathology (AMP)/American Society of Clinical Oncology (ASCO)/College of American Pathologists (CAP) mo te whakamaoritanga o te rereketanga somatic e wehewehe ana i te rereketanga somatic ki nga waahanga e wha: Koeke I, me te tino hiranga haumanu; Koeke II, me te hiranga haumanu pea; Koeke III, kaore e mohiotia te hiranga haumanu; Koeke IV, kaore i te mohiotia he tino nui te haumanu. Ko nga momo tohu I me II anake he mea nui mo nga whakatau maimoatanga.
Ka whakarōpūhia e te Molecular Target Clinical Operability Scale (ESCAT) a ESMO nga momo ira ki nga taumata e ono: Taumata I, nga whaainga e tika ana mo te whakamahi i nga wa katoa; Ko te Wāhanga II, he kaupapa e rangahauhia tonutia ana, tera pea ka whakamahia ki te tirotiro i te taupori turoro ka whai hua mai i te raau taero, engari me nui ake nga raraunga hei tautoko. Koeke III, nga momo ira i whaaia kua whakaatu i te painga haumanu ki etahi atu momo mate pukupuku; Koeke IV, ko nga momo ira e whaaia ana e tautokohia ana e nga taunakitanga preclinical; I te reanga V, he taunakitanga hei tautoko i te hiranga haumanu o te whakangao i te rerekeetanga, engari ko te rongoa rongoa kotahi ki te whaainga kaore e roa te oranga, ka taea ranei te whakamahi rautaki maimoatanga whakakotahi; Koeke X, te kore o te uara haumanu.