rongo

I whakawhiwhia te Lasker Basic Medical Research Award i tenei tau ki a Demis Hassabis raua ko John Jumper mo a raua koha ki te hanga i te punaha matauranga artificial AlphaFold e tohu ana i te hanganga ahu-toru o nga pūmua i runga i te raupapa tuatahi o nga waikawa amino.

Ko o raatau hua ka whakaoti rapanga kua roa e whakapouri ana i te hapori putaiao me te whakatuwhera i te kuaha ki te whakatere rangahau puta noa i te mara rongoa koiora. Ka whai wāhi nui nga pūmua ki te whakawhanaketanga o te mate: i te mate o Alzheimer, ka piu, ka piri tahi; I roto i te mate pukupuku, ka ngaro to raatau mahi ture; I roto i nga mate o roto i te whanautanga, he kino te mahi; I roto i te cystic fibrosis, ka haere ki te waahi he i roto i te pūtau. He iti noa enei o nga tikanga maha e puta ai te mate. Ka taea e nga tauira hanganga pūmua taipitopito te whakarato i nga whirihoranga ngota, te taraiwa i te hoahoa, te kowhiringa ranei o nga ngota ngota tino hononga, me te whakatere i te kitenga tarukino.

Ko nga hanganga pūmua e whakatauhia ana e te whakaataata-a-rorohiko, te resonance autō karihi me te moroiti cryo-electron. Ko enei tikanga he utu nui me te wa-kai. Ko te hua tenei ko nga papaa raraunga hanganga pūmua 3D me te tata ki te 200,000 noa nga raraunga hanganga, i te mea kua whakaputahia e te hangarau raupapa DNA neke atu i te 8 miriona raupapa pūmua. I nga tau 1960, Anfinsen et al. I kitea ka taea e te raupapa 1D o nga waikawa amino te huri noa me te tukurua ki roto i te hangahanga ahu-toru (Whakaahua 1A), a ka taea e nga "chaperones" ngota ngota te whakatere me te whakahaere i tenei mahi. Ko enei tirohanga ka arahi ki te wero 60-tau i roto i te koiora ngota: matapae i te hanganga 3D o nga pūmua mai i te raupapa 1D o nga waikawa amino. Na te angitu o te Kaupapa Genome Tangata, kua tino pai ake to maatau kaha ki te whiwhi raupapa waikawa amino 1D, a kua kaha ake tenei wero.

He uaua te matapae i nga hanganga pūmua mo etahi take. Tuatahi, ko nga tuunga ahu-toru katoa o ia ngota i roto i ia waikawa amino me nui te torotoro. Tuarua, ka kaha te whakamahi a nga pūmua i te whakakoi i roto i te hanganga matū hei whirihora tika i nga ngota. I te mea he maha nga rau o nga "kaituku" here hauwai (te nuinga o te hāora) e tata ana ki te "kaiwhakaae" here hauwai (te nuinga o te hauota ka herea ki te hauwai), he tino uaua ki te kimi i nga ritenga kei te tata ki nga kaituku katoa e tata ana ki te kaiwhiwhi. Tuatoru, he iti noa nga tauira mo te whakangungu i nga tikanga whakamatautau, na reira me mohio ki nga tauwhitinga e toru-ahu i waenga i nga waikawa amino i runga i nga raupapa 1D ma te whakamahi i nga korero mo te whanaketanga o nga pūmua e tika ana.

I whakamahia tuatahi te ahupūngao ki te whakatauira i te tauwhitinga o nga ngota ki te rapu i te ahua pai rawa atu, ka hangaia he tikanga hei matapae i te hanganga o nga pūmua. I whakawhiwhia a Karplus, Levitt me Warshel ki te Tohu Nobel mo te Matū o te tau 2013 mo a raatau mahi mo te whakatauira rorohiko o nga pūmua. Heoi, he nui te utu o nga tikanga ahupūngao me te tata ki te tukatuka, na reira kaore e taea te matapae i nga hanganga ahu-toru. Ko tetahi atu huarahi "matauranga-matauranga" ko te whakamahi i nga papaaarangi o nga hanganga mohio me nga raupapa hei whakangungu tauira ma te mohio mohio me te ako miihini (AI-ML). Ko te Hassabis me te Jumper e whakamahi ana i nga huānga o te ahupūngao me te AI-ML, engari ko te auahatanga me te pekepeke o te huarahi i ahu mai i AI-ML. I whakakotahihia e nga kairangahau e rua nga papaunga raraunga whanui me nga rauemi rorohiko-a-ahumahi hei hanga AlphaFold.

Me pehea tatou e mohio ai kua "whakaoti" ratou i te panga matapae hanganga? I te tau 1994, i whakatüria te whakataetae Aromatawai Aromatawai o te Matapae Hanganga (CASP), ka hui ia rua tau ki te whai i te ahunga whakamua o te matapae hanganga. Ka tohatohahia e nga kairangahau te raupapa 1D o te pūmua kua whakatauhia e ratou te hanganga, engari ko nga hua kaore ano kia whakaputaina. Ka matapaehia e te kaitoi te hanganga ahu-toru ma te whakamahi i tenei raupapa 1D, ka whakatauhia e te kaiarotake te kounga o nga hua matapae ma te whakatairite ki te hanganga ahu-toru e whakaratohia ana e te kai-whakamatautau (ka hoatu ki te kaiarotake anake). Ka whakahaerehia e CASP nga arotake matapo pono me te tuhi i nga peke mahi i ia wa e pa ana ki nga tikanga hou. I te Huihuinga 14th CASP i te tau 2020, i whakaatu nga hua matapae a AlphaFold i te pekepeke i roto i nga mahi i kii nga kaiwhakarite kua whakatauhia te raruraru matapae hanganga 3D: ko te tika o te nuinga o nga matapae he tata ki tera o nga inenga whakamatautau.

Ko te hiranga whanui ko te mahi a Hassabis raua ko Jumper e whakaatu ana me pehea te whakarereke a AI-ML i te aoiao. Ko ana rangahau e whakaatu ana ka taea e AI-ML te hanga i nga whakapae pütaiao matatini mai i nga puna raraunga maha, ka taea e nga tikanga aro (he rite ki era i ChatGPT) ka kitea nga whakawhirinakitanga matua me nga hononga i roto i nga puna raraunga, a ka taea e AI-ML te whakatau i te kounga o ana hua whakaputa. Ko AI-ML te mahi putaiao.